
浙江托普云農(nóng)科技股份有限公司研發(fā)的植物根系分析系統(tǒng)(含GXY-A/B系列及根系原位監(jiān)測(cè)系統(tǒng)),是一套集高精度成像硬件與AI圖像解析算法于一體的國(guó)產(chǎn)科研級(jí)根系表型分析平臺(tái),用于植物根系形態(tài)學(xué)參數(shù)、拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)及根瘤共生關(guān)系的定量測(cè)定。
一、系統(tǒng)構(gòu)成與工作原理
硬件組成
成像單元:標(biāo)配雙光源透掃掃描儀或2200萬(wàn)像素級(jí)專用高拍儀(含可調(diào)背光板、防反光壓板),確保根系無(wú)陰影均勻成像;原位監(jiān)測(cè)型另配顯微攝像模組或CMOS傳感器。
控制與標(biāo)定:內(nèi)置像素—物理尺寸自動(dòng)標(biāo)定模塊,配合暗箱屏蔽環(huán)境光干擾。
軟件平臺(tái):搭載專用根系分析軟件,支持本地運(yùn)算及"指尖耕耘"云平臺(tái)數(shù)據(jù)同步。
工作原理
將經(jīng)清洗處理的離體根系平鋪于掃描面/拍攝臺(tái),或借助微根管(Minirhizotron)對(duì)原位根系連續(xù)采集圖像;軟件采用計(jì)算機(jī)視覺(jué)與深度學(xué)習(xí)分割算法,自動(dòng)將根系從背景中二值化分離,通過(guò)像素映射換算為實(shí)際物理量,提取形態(tài)與拓?fù)鋮?shù)。
二、核心分析功能
根系分析功能:
1、拓?fù)浞治觯耗茏詣?dòng)進(jìn)行根系的拓?fù)浞治觯詣?dòng)確定根的連接數(shù)、長(zhǎng)度、體積等參數(shù),可自動(dòng)區(qū)分側(cè)根等級(jí)自動(dòng)分析主根或任意一支側(cè)根的參數(shù)等,根系等級(jí)分為6級(jí),使根系分析更加準(zhǔn)確;
2、連接分析:可分析準(zhǔn)確分析根系內(nèi)各根段的角度關(guān)系;
3、分段測(cè)量:可通過(guò)直徑、投影面積、表面積、體積和長(zhǎng)度進(jìn)行根系分段和分檔,并可自定義進(jìn)行分檔設(shè)置,自動(dòng)測(cè)量各直徑段長(zhǎng)度、投影面積、表面積、體積等,及其分布參數(shù),并輸出數(shù)據(jù)直方圖,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)可視化
4、智能校正,結(jié)果更精準(zhǔn):可對(duì)根系進(jìn)行合并分叉、刪除連接、合并根尖、斷開(kāi)連接、毛刺去除、主根修正、側(cè)根修正、根粗修正等校正,可操作性強(qiáng);
5、自動(dòng)剔除雜點(diǎn):通過(guò)設(shè)定像素值剔除雜點(diǎn),凸顯目標(biāo)根系輪廓;
6、自動(dòng)標(biāo)定:用戶輸入掃描像素后,軟件自動(dòng)換算實(shí)際長(zhǎng)度;
7、個(gè)性化顯示,觀察更輕松:支持對(duì)圖片分析的參數(shù)進(jìn)行勾選設(shè)置,可用不同顏色顯示出根系的端點(diǎn)、關(guān)節(jié)點(diǎn)、連接線段、主根、1-6級(jí)側(cè)根和低級(jí)側(cè)根,便于檢測(cè)中的直觀顯示與區(qū)分;
8、圖片二值化:調(diào)整圖片灰度對(duì)比,更好分割根系和調(diào)整背景,使分析結(jié)果更準(zhǔn)確;
9、還原至初始圖片:可將分析或操作后的圖片還原為剛打開(kāi)時(shí)的狀態(tài);
10、目標(biāo)區(qū)域分析:可手動(dòng)選擇想要測(cè)定的目標(biāo)區(qū)域,只對(duì)選定的目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行分析,分析更加靈活,增加數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性。
一鍵分析多項(xiàng)參數(shù):一鍵操作,精準(zhǔn)獲取根總數(shù)、根尖數(shù)量、根總長(zhǎng)、根平均直徑、根總投影面積、根總體積、R/G/B、RHS、總連接點(diǎn)數(shù)、端點(diǎn)、關(guān)節(jié)點(diǎn)、連接點(diǎn)數(shù)、分叉數(shù)、交疊數(shù)、盒維數(shù)等多項(xiàng)參數(shù);
軟件加密、數(shù)據(jù)更安全:采用動(dòng)態(tài)二維碼+密碼狗加密,登記具體使用單位的信息,防止jia密狗的丟失;
大批量全自動(dòng)分析:?jiǎn)未慰膳糠治?00張以上圖片,自動(dòng)保存分析結(jié)果,省時(shí)省力;
數(shù)據(jù)自動(dòng)保存:可隨時(shí)暫停或繼續(xù)分析數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)進(jìn)度自動(dòng)保存;
數(shù)據(jù)導(dǎo)出表格化:將圖片或數(shù)據(jù)導(dǎo)出至文件夾,數(shù)據(jù)可導(dǎo)出Excle格式追加至文件夾下方;
自帶指尖耕耘手機(jī)app與云平臺(tái):多平臺(tái)共享數(shù)據(jù),可實(shí)時(shí)查看與導(dǎo)出;多平臺(tái)備份數(shù)據(jù),長(zhǎng)期保存不防丟失
三、典型應(yīng)用領(lǐng)域
植物生理與生態(tài)學(xué)研究:根系構(gòu)型建成、細(xì)根周轉(zhuǎn)、根系–土壤互作機(jī)制解析。
作物遺傳育種:水稻、小麥、玉米、大豆等種質(zhì)資源根系性狀關(guān)聯(lián)分析與優(yōu)異基因型篩選。
抗逆與脅迫研究:干旱、鹽堿、重金屬污染條件下根系形態(tài)及活力變化的量化評(píng)估。
農(nóng)林與環(huán)境修復(fù):植被根系固土能力評(píng)價(jià)、植物修復(fù)潛力篩選及生態(tài)恢復(fù)監(jiān)測(cè)。
精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)管理:依據(jù)根系構(gòu)型特征優(yōu)化種植密度、灌溉深度與施肥方案。
四、學(xué)術(shù)價(jià)值評(píng)述
托普云農(nóng)根系分析系統(tǒng)以國(guó)產(chǎn)化軟硬一體方案取代傳統(tǒng)人工格網(wǎng)測(cè)量,克服了主觀誤差大、通量低、參數(shù)維度單一的局限,使植物地下部表型從定性描述進(jìn)階為亞像素級(jí)定量解析,是當(dāng)前植物根系形態(tài)學(xué)與表型組學(xué)研究中具備代表性的本土化實(shí)驗(yàn)裝備。
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